بطور طبیعی در روده انسان تعداد بسیار زیادی باکتری وجود دارد که با انسان همزیستی مسالمت آمیز دارند. البته به غیر از باکتریهای مفید باکتریهای مضر هم وجود دارد ولی غالبا 85 درصد باکتریهایی که فلور طبیعی روده را تشکیل می دهند باکتریهای مفید هستند. این باکتریهای اثرات مثبتی روی سلامتی انسان دارند. دسته ای از این باکتریها که به باکتریهای پروبیوتیک معروف هستند علاوه براینکه به گوارش کمک می کنند؛ در بدن ویتامین می سازند و آنتی بیوتیک و اسیدهای آلی تولید می کنند.اگر باکتریهای خوب روده انسان از بین بروند؛ سیستم ایمنی بدن تحت تاثیر قرار می گیرد، ممکن است دچار بیماری های خود ایمن، آلرژی غذایی، مشکلات گوارشی، آکنه،مشکلات پوستی، خستگی مفرط، افسردگی ، سردرد و سرماخوردگی های مکرر شویم.
بطور طبیعی باکتریهای پروبیوتیک از طریق میوه و سبزیجات تازه،غذاهای تخمیری و لبنیات می توانند وارد رژیم غذایی ما شوند اما امروزه به دلیل استفاده از سموم کشاورزی و آنتی بیوتیکها این باکتریهای مفید از بین می روند و نه تنها باکتریهای پروبیوتیک از طریق غذا وارد بدن ما نمی شوند بلکه ورود آنتی بیوتیکها به بدن باعث نابودی باکتریهایی مفید بدن نیز می شود.